🧪 GlycoRes Hub

糖生物学研究必备数据库与工具导航

🌐 综合门户与资源库 (Portals)

GlyGen

综合

美国 NIH 资助的数据整合项目,集成了糖结构、糖蛋白、基因和功能数据,是目前最全的入口之一。

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GlyCosmos

综合

日本集成的糖科学门户,整合了 GlyTouCan、GlycoProtDB 等多个重要子库,界面友好。

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ExPASy Glyco

工具集

瑞士生物信息学研究所提供的糖生物学工具集合页面,包含 GlycoMod, GlycanMass 等经典工具。

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🧬 糖结构与糖蛋白数据库 (Structure)

GlyTouCan

ID 库

国际糖结构存储库。类似于 PDB 或 GenBank,为每一个独特的糖链结构分配唯一的 Accession Number。

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UniCarbKB

糖蛋白

专注于糖基化位点和糖蛋白结构的数据库,包含大量质谱验证的 O-糖和 N-糖数据。

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CSDB

微生物/植物

碳水化合物结构数据库,重点收录细菌、真菌和植物的糖链结构及 NMR 数据,做天然产物必备。

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✂️ 糖酶与凝集素 (Enzymes & Lectins)

CAZy

权威

碳水化合物活性酶数据库。糖生物学界的“圣经”,对糖苷水解酶、转移酶等进行家族分类 (GH, GT 等)。

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UniLectin

凝集素

基于结构分类的凝集素数据库,提供凝集素的三维结构、特异性结合糖链的信息。

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MEROPS

蛋白酶

虽然主要是蛋白酶库,但对于研究糖蛋白的酶切处理(如切除多肽部分)非常重要。

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⚡ 预测与质谱分析工具 (Tools)

NetNGlyc 1.0

N-糖预测

经典的 N-糖基化位点预测服务器,基于人工神经网络预测 Asn-Xaa-Ser/Thr 序列。

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NetOGlyc 4.0

O-糖预测

预测粘蛋白型 GalNAc O-糖基化位点的工具,最新版利用了神经网络。

访问 NetOGlyc

GlycoMod

质谱分析

输入实验测得的质量数,预测可能的寡糖组成结构。是解析糖组学质谱数据的经典工具。

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🎨 绘图与标准 (Visualization)

SNFG 标准

绘图标准

NCBI 提供的 SNFG (Symbol Nomenclature for Glycans) 官方指南。查看那个蓝色方块和绿色圆圈到底代表什么。

查看 SNFG 指南

GlycoWorkbench

绘图软件

最常用的糖结构辅助绘图与质谱注释软件(Java程序),支持半自动绘图和碎片离子计算。

下载 GlycoWorkbench

DrawGlycan-SNFG

在线绘图

基于 Web 的工具,通过输入简单的文本代码(IUPAC字符串)自动生成符合 SNFG 标准的高质量糖链图片。

使用 DrawGlycan